在这种情况下，可以通过其他途径解决。如果公司经营管理发生严重困难，继续存续会使股东利益受到重大损失，且通过其他途径不能解决，持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东，可以请求人民法院解散公司。注销公司的过程涉及多个步骤，包括税务注销、工商注销、银行注销等，需要按照规定的程序和要求进行。

请注意，注销公司涉及到复杂的法律程序和财务问题，因此建议在进行注销操作前，寻求专业的法律咨询和财务审计，以确保注销过程的合规性和顺利进行。同时，与股东之间的沟通和协调也是非常重要的，以避免不必要的纠纷和损失。

此外，如果股东不配合注销公司，可能会对公司的声誉和信用产生负面影响。因此，建议在注册公司时，就明确各方的权利和义务，并签订相关协议，以规避潜在的风险和问题。

所以即使股东不配合，公司仍然可以注销，但需要遵循相应的法律程序和规定。